第二届MNE-Python脑电数据处理班


    思影科技将于2021826日--831日(周四至下周二)在上海举办第二届MNE- Python脑电数据处理班(详见课表安排)。


1、培训简介

脑电相关技术(例如EEG/ERP/ERSP等)自上世纪末以来在基础研究、工程和临床实践等领域取得广泛应用。目前,随着设备的不断升级,研究方法的不断进步,脑电数据分析中的算法和指标也不断更新。从头皮脑电的时域分析、频域/时频域分析、功能连接分析、溯源以及溯源后的网络分析等,到颅内脑电解码以及深度学习,这都要求着科研人员对现有的研究方法和数据处理平台有更全面的把握,这无形之中对研究者们的编程技能有着更高的要求。因此选择一个功能丰富、强大、又易于使用的编程平台至关重要。

近年来,人工智能领域的发展如火如荼,Python语言因其严谨、优雅、强大的可扩展性受到业界人员的青睐。在脑电领域也由相关社区开发出了相应的工具包:MNE-Python。这是一款专门用来处理EEG、EMG、ECG等生理数据的Python工具库,能够高效分析、可视化脑电/脑磁数据。相比于其他的软件和平台,它的最大特点是:(1)灵活的分析。基于Python的很多机器学习和深度学习库,可以很方便地结合使用;(2)丰富的可视化。基于Python的可视化库有很多,像matplotlib,seaborn等,可以灵活选择;(3)相比于matlab等软件,python属于开源软件,使用限制更少。

针对于此,我们拟举办脑电信号处理分析培训班,专注于培训强大的开源脑电数据处理软件(MNE)的操作技能以及python等软件的编程技能,并开展诸如时域分析、时频分析、功能连通性分析和源定位等脑电分析课程,旨在帮助刚踏入脑电领域的心理学、生物医学工程、神经科学等学科的研究生与各科医生及临床科研人员快速了解并掌握相关方法,深度挖掘脑电数据中的有用信息,发表更高质量的科研论文和成果。

2、培训对象

本次培训班面向的对象是希望利用脑电技术进行科研和临床研究的医生、研究人员等,学员需具备一定的基础,培训班进行小班授课,重点培训学员操作,并且后续提供在线解答、支持,及时解决学员问题。

内容主要包括:脑电基本概念和原理,Python编程基础,脑电信号预处理(MNE);脑电信号的批处理;脑电信号的时域分析;脑电频域分析;脑电时频分析;EEG功能连接分析;基于MNE的源定位分析。

注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(10:00-20:00)熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜,上课时间(上午9:00-12:00,下午14:00-17:00,晚上18:00-21:00)。

3、课程安排

时间

课程名

主要内容

第一天

8.26

裘吉成

Python编程基础


基本数据类型:数字、字符串、列表、元组、字典等。

 

 

流程控制:分支语句、循环语句等。

 

Python编程基础

 

Python函数与脚本的编写


 

面向对象编程:类、对象、方法等。

 

Python编程基础

 

脑电数据处理相关的Python技能:Python包的安装(pip/conda)、常用函数/类等。

 


第二天

8.27

王梦如

脑电基本概念和原理

 

脑电基本概念和原理:生理机制、脑电节律、伪迹和干扰、ERP等

 

MNE-python脑电信号预处理

 

MNE:启动、数据导入、选择电极、重参考、滤波、分段、伪迹剔除、独立成分分析(ICA)等

 

MNE-python脑电信号批处理

 

编写MNE-python脑电信号预处理的批处理脚本

 

 

第三天

8.28

王梦如

脑电信号的时域分析:锁时锁相特征的提取

 

单个被试和组平均波形的计算和绘制

 


ERP特征刻画:潜伏期、幅度和拓扑图

 

 

感兴趣区域的提取

 

时域结果的统计与报告

 

不同条件间ERP特征的比较:t检验与方差分析

 

 

ERP响应与行为数据的相关

 


时域结果的总结与呈现

 

总结与回顾

 

MNE-python时域分析的总结与回顾


第四天

8.29

贾会宾

脑电频域分析

 

频域分析的概念:频域信号、傅里叶变换等。


 

脑电信号的频域分析思路:频域变换与统计。

 

 

基于MNE-Python的频域分析:功率谱/功率谱密度分析。


脑电时频分析

 

时频分析的概念:短时傅里叶变换、小波变换等。

 


脑电信号的时频分析思路:时频变换与统计。

 

脑电时频分析


基于MNE-Python的时频分析

 


频域/时频分析小结

 

第五天

8.30

杨田雨

 

功能连接原理


脑连接组的概念

 


功能连接常见指标:相干(COH)、相位锁定值(PLV)、相位延迟指数(PLI)等。

 

功能连接计算


使用MNE-Pythonconnectivity模块进行功能连接的计算


功能连接的统计


功能连接统计思路:连边分析与多重比较校正。



结果展示


第六天

8.31

杨田雨

脑电溯源原理及操作


脑电溯源原理介绍



基于MNEERP溯源实操



溯源结果展示与统计


源空间ROI定义及信号提取


源空间ROI的定义方式


 

源空间ROI的信号提取


4、培训人数

此次课程限定人数,报名敬请从速。

5、培训地点

上海市宝山区沪太路3100号尚大国际D319室,具体见会议指南。

6、培训费用

所有参会人员3500/人(含资料费、培训费,交通及食宿费自理)。

7、报名方式

请将报名回执发送至:syfmri@vip.163.com

8、缴费方式

银行转账(转账信息见回执表)或者支付宝(shsyfmri@163.com户名:上海集影科技有限公司),也可现场刷公务卡,如需其他缴费方式,请与我们联系,联系方式见下文,谢绝录像,主办方提供发票。

9、联系方式

联系人:杨晓飞。

电话:021-56635712/18580429226

10、备注

请各位学员自带笔记本电脑Windows64位系统((推荐win10)i5及以上、8G内存、50G剩余存储空间等基本配置;如无特殊情况请不要带苹果电脑,如确实只能用苹果电脑,苹果Mac电脑请提前使用Bootcamp加装Windows64位系统);学员自己有数据的可以带3-5例进行现场处理;请将回执表发送至syfmri@vip.163.com并及时缴费,便于安排。随申码(上海健康码),思影科技提供口罩。

报名回执表

单位名称、税号

(发票抬头)

姓名

性别

邮箱

电话号码

科室/专业

缴费方式

转账  支付宝 刷卡(请选择在

银行信息

户名:上海集影科技有限公司

账号:1001203209300045983

开户银行:中国工商银行股份有限公司上海市大场支行

汇款备注

第二届MNE-Python脑电数据处理班+姓名

注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给你发送确认函,谢谢支持!

11、在线支持服务

思影科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持与合作,确保学员能够熟练掌握数据处理方法。

12、培训人员简介:

贾会宾,博士,2020年毕业于东南大学神经信息工程专业,目前为河南大学教师。研究方向为基于多模态脑成像技术(EEGfNIRSfMRI)的临床神经心理疾病辅助诊断。已在相关领域学术杂志期刊发表学术论文20余篇,其中第一作者SCI收录学术论文十余篇。

杨田雨,硕士,拥有数学与计算机学科背景,擅长脑成像领域方法学,思影科技技术总监。

裘吉成,硕士,思影科技高级工程师。

王梦如,硕士,思影科技高级工程师。

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脑电及红外、眼动:北京:

第十届眼动数据处理班(北京,6.27-7.2)


第十三届近红外脑功能数据处理班(北京,7.18-23)


第三十届脑电数据处理中级班(北京,8.5-10)


第四届脑电机器学习数据处理班(北京,8.11-16)
上海:

第三届脑电机器学习数据处理班(上海,6.25-30)
第九届脑电信号数据处理提高班(上海,7.8-13)


第二十九届脑电数据处理中级班(上海,7.16-21)


第十七届脑电数据处理入门班(上海,8.1-6)


重庆:

第十五届脑电数据处理入门班(重庆,7.12-17)


第十四届近红外脑功能数据处理班(重庆,8.14-19)


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磁共振:

上海:

第十八届DTI数据处理班(上海,7.2-7)


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第十届任务态功能磁共振数据处理班(上海,8.12-17)


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北京:


第十四届磁共振脑影像结构班(北京,7.10-15)


第四十四届磁共振脑影像基础班(北京,7.29-8.3)


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第四十三届磁共振脑影像基础班(南京,7.1-6)


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第九届磁共振ASL数据处理班(南京,8.5-8)


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第四十五届磁共振脑影像基础班(重庆,8.26-31)


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