1、培训简介
近年来,弥散磁共振成像(dMRI)领域在成像技术、数据处理方法上都取得了重要进展。相对于传统的弥散张量成像(DTI),高角分辨率扩散成像HARDI很好地解决了纤维交叉问题,而神经突方向分散度和密度成像(NODDI)对白质微结构异常具有更高的特异性,对神经元细胞内外组织及脑脊液有更好的区分度,在大脑发育及老化、脑血管病变、脑神经损伤等方面的研究取得了诸多成果。弥散谱成像(DSI)则具有更高的空间分辨率,可以更精确地追踪具有复杂走形的纤维束,有效地弥补了DTI的不足,已成为脑连接组研究和临床疾病探索的潜力技术。弥散成像序列的数据处理方法近年来也有一些革新,比如基于Fixel的分析方法,可以估计纤维束密度、纤维束横截面面积等指标,另外表面皮层追踪相关研究层出不穷,在脑发育及脑疾病研究领域硕果累累,这些技术革新为研究人员提供了新的研究思路和视野,相关高质量的研究成果也层出不穷。
基于此,思影科技拟举办弥散磁共振成像数据处理提高班,旨在帮助相关领域临床医生及脑影像研究者掌握最前沿的dMRI成像及数据处理技术,以期进行更新颖的学术研究。如果您需要基础的弥散磁共振成像分析技术欢迎浏览思影科技的脑影像基础班及弥散张量成像课程等。
2、培训对象
本次培训班面向的对象是一些希望利用弥散磁共振成像技术进行脑科学科研和临床研究的研究人员及医生等,适合有一定基础的相关从业人员进行学习。如需要弥散磁共振成像的基础知识,可参加思影科技的磁共振弥散成像数据处理班,相关内容可参阅思影科技公众号及网站。参加本次课程的学员可免费重修一次。
内容主要包括:工作环境的准备(虚拟机、Linux系统基础知识等);高角分辨率弥散磁共振成像(HARDI);神经突方向分散度和密度成像(NODDI);Constrained Spherical Deconvolution(csd)方法,Diffusion spectrum imaging(DSI);基于CST/DSI的脑网络构建与指标计算;superficial white matter analysis表面白质纤维分析;基于Fixel的数据分析(纤维束密度及横截面积计算);
注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(11:00-20:00)熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜。培训班上课时间上午9:00-12:00,下午14:00-17:00。
3、课程安排
时间 |
课程名 |
主要内容 |
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第一天 谢桑马 9.23
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上午 |
准备工作和Diffuision MRI基本原理及采集策略介绍 |
熟悉工作环境:虚拟机的使用,Linux系统基础操作,相关软件基本使用 Diffusion MRI基本概念和原理 DTI/DKI/HARDI/DSI等模型数据采集 |
下午 |
dMRI预处理(基础版+进阶版) |
dMRI数据预处理(基本版):数据格式转换;头动涡流矫正;获取大脑mask。 dMRI数据预处理(进阶版):数据格式转换;DWI去噪;Gibbs ringing矫正;Topup;eddy;N4BiasFieldCorrection; |
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晚上 |
高角分辨率弥散磁共振成像(HARDI)的基本原理及应用 |
HARDI的基本概念和原理 HARDI的分析方法和应用示例 HARDI的基本数据处理演示 |
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第二天 谢桑马 9.24 |
上午 |
NODDI的基本原理和计算 |
NODDI的基本概念和原理 NODDI的应用示例 NODDI相关指标计算和统计分析 |
下午 |
CSD方法的基本原理介绍和相关软件实践操作 |
CSD方法的基本原理 基于CSD的纤维方向分布函数估计 基于CSD的全脑纤维跟踪 基于CSD的纤维密度图计算 |
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第三天裘吉成9.25 |
上午 |
DSI数据分析 |
DSI原理简介 DSI数据准备 DSI指标计算 DSI纤维束追踪 |
下午 |
DSI纤维束可视化显示 DSI纤维束分析和统计 DSI命令行批处理介绍 |
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第四天 裘吉成 9.26 |
上午 |
基于CSD和DSI的脑网络构建与分析 |
基于CSD、DSI的纤维追踪以及脑网络构建原理 脑网络构建实操 |
下午 |
脑网络拓扑属性计算及简单统计 |
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第五天 谢桑马 9.27 |
上午 |
Superficial white matter (SWM)介绍 |
Superficial white matter(SWM)简介 SWM分析方法介绍 SWM应用示例介绍 SWM分析数据要求 MRtrix软件介绍与操作 |
下午 |
SWM分析实操 |
基于ROI的SWM分析实操(基础版) 基于纤维跟踪的SWM分析实操(进阶版) |
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晚上 |
基于Fixel的数据分析 |
Fixel的基本概念 Fixel-Based Analysis(FBA)原理简介 FBA数据采集策略 |
第六天谢桑马9.28 |
上午 |
FBA实操 |
纤维束密度(FD)、纤维束横截面积(FC)、纤维束密度&横截面积(FCD)等指标的计算 |
下午 |
FBA实操 |
FBA指标的统计分析 FBA数据批处理的实现方式 FBA指标结果可视化 |
4、培训人数
此次课程限定人数,报名敬请从速。
5、培训地点
上海市宝山区沪太路3100号尚大国际D座319室,具体见会议指南。
6、培训费用
所有参会人员4000/人(含资料费、培训费,交通及食宿费自理)。
7、报名方式
请将报名回执发送至:syfmri@vip.163.com
8、缴费方式
银行转账(转账信息见回执表)或者支付宝(shsyfmri@163.com,户名:上海集影科技有限公司),也可现场刷公务卡,如需其他缴费方式,请与我们联系,联系方式见下文,谢绝录像,主办方提供发票。
9、联系方式
联系人:杨晓飞。
电话:021-56635712/18580429226
10、备注
请各位学员自带笔记本电脑Windows64位系统((推荐win10)、i5及以上、8G内存、50G剩余存储空间等基本配置;如无特殊情况请不要带苹果电脑,如确实只能用苹果电脑,苹果Mac电脑请提前使用Bootcamp加装Windows64位系统);学员自己有数据的可以带3-5例进行现场处理;请将回执表发送至syfmri@vip.163.com并及时缴费,便于安排。随申码(上海健康码),思影科技提供口罩。
报名回执表
单位名称、税号 (发票抬头) |
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姓名 |
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性别 |
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邮箱 |
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电话号码 |
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科室/专业 |
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缴费方式 |
□转账 □支付宝 □刷卡(请选择在□打√) |
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银行信息 |
户名:上海集影科技有限公司 账号:1001203209300045983 开户银行:中国工商银行股份有限公司上海市大场支行 |
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汇款备注 |
第四届弥散磁共振成像数据处理提高班+姓名 |
注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给你发送确认函,谢谢支持!
11、在线支持服务
思影科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持与合作,确保学员熟练掌握数据处理方法。
12、培训人员简介:
谢桑马,博士,2017年1月毕业于中国科学院自动化研究所。主要研究方向为扩散磁共振成像的计算理论和方法、脑影像数据分析软件开发以及扩散磁共振成像在精神疾病中的应用。扩散磁共振成像分析软件DiffusionKit的主要开发者,获得软件著作权一项。熟练掌握扩散磁共振成像领域的主流方法,精通相关软件的操作使用。目前,已在PLOS ONE、Journal of Neuroscience Methods、Translational Psychiatry等国际杂志以第一作者发表SCI论文3篇,参与多项国家自然基金项目,同时担任国际期刊IEEE Transactions on Medical Imaging等杂志审稿人。
裘吉成,硕士,思影科技高级工程师。
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核磁:
北京:
第一届任务态fMRI提高班(北京,8.25-30)
第二届MNE-Python脑电数据处理班(上海,8.26-31)
南京:
数据处理业务介绍:
第十六届脑影像机器学习班(上海,7.23-28)
第三十届脑电数据处理中级班(北京,8.5-10)
第四届脑电机器学习数据处理班(北京,8.11-16)
第十三届近红外脑功能数据处理班(北京,7.18-23)
上海:
思影科技弥散加权成像(DWI/dMRI)数据处理
思影科技脑结构磁共振成像数据处理业务(T1)
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思影科技脑影像机器学习数据处理业务介绍
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招聘及产品:
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