1、培训简介
肠道菌群和肠道微生态如何调节免疫功能和相关疾病,是目前生物学与医学交叉研究的最前沿。新一代测序(NGS)的出现催生了人类微生物组计划,发表了大量人类微生物组的相关数据。然而微生物组的分析受下游分析(如质量控制、组装、分类和统计分析)的严重影响。许多临床科研人员受限于分析技术的缺乏,鉴于此,我们拟举办微生物菌群分析班,旨在帮助想要通过微生物群落的分析来探索肠道微生物与免疫、内分泌、神经系统疾病和代谢产物等之间关系的医生和科研工作者等快速掌握数据分析的相关方法和流程。
本届课程的内容是通过16S rRNA测序和宏基因组学测序结果来带领大家熟悉微生物群落的数据分析工作流程,并提供关于测序后数据的质量控制、组装、注释、可视化和统计分析的最佳实践方案。
2、培训对象
本次培训班面向的对象是希望利用微生物菌群进行临床研究的医生、研究人员等,培训班进行小班授课,重点培训学员操作,并且后续提供在线解答、支持,及时解决学员问题。参加本次课程的学员可免费重修一次。
内容主要包括:R/RStudio基础与入门,Linux基本操作,微生物群落分析介绍与数据预处理,微生物群落多样性分析:16s扩增子测序和宏基因组测序介绍;指标计算与统计等。注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(10:00-20:00)熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜,上课时间(9:00-12:00,下午14:00-17:00,晚上18:00-21:00)。
3、课程安排
时间 |
课程名 |
主要内容 |
第一天 1.7 张嫡嫡 |
R/RStudio基础与入门 |
R/RStudio界面简介。
R的基本命令。 R的数据结构(向量、矩阵、数据框、因子化等)及其创建、访问和修改。
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R统计分析基础 |
统计相关包、函数介绍。
R 语言统计分析基础:数据清洗与可视化。
R作图实操:柱形图,点图等
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Linux基本操作 |
常规基础 Linux 命令入门讲解。
Linux常规命令实操训练。
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第二天 1.8 王世明 |
微生物群落分析介绍 |
16s扩增子测序和宏基因组测序简介。
测序结果文件介绍。
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数据预处理 |
数据处理流程简介。
预处理实操:质量控制,组装,分类,功能分类。
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第三天 1.9 王世明 |
微生物群落多样性 |
微生物群落多样性指标简介。
指标计算实操1:多样性指数,香农指数。
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微生物群落多样性 |
指标计算实操2:主成分分析(PCA);差异丰度检验;成分相似性。
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4、培训人数
此次课程限定人数,报名敬请从速。
5、培训地点
南京市玄武区珠江路657号东鼎大厦B座702室(锦创数字产业园),具体见会议指南。
6、培训费用
所有参会人员 2000 /人(含资料费、培训费,交通及食宿费自理)。
7、报名方式
请将报名回执发送至:syfmri@vip.163.com
8、缴费方式
银行转账(转账信息见回执表)或者支付宝(shyfmri@163.com,户名:南京思恒影科技有限公司),也可现场刷公务卡,如需其他缴费方式,请与我们联系,联系方式见下文,谢绝录像,主办方提供发票。
9、联系方式
联系人:杨晓飞。
电话:025-86703770 /18580429226
10、备注
请各位学员自带笔记本电脑Windows64位系统((推荐win10)、i5及以上、8G内存、50G剩余存储空间等基本配置;如无特殊情况请不要带苹果电脑,如确实只能用苹果电脑,苹果Mac电脑请提前使用Bootcamp加装Windows64位系统);学员可带自有数据进行现场处理;请将回执表发送至syfmri@vip.163.com并及时缴费,便于安排。
报名回执表
单位名称、税号 (发票抬头) |
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姓名 |
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性别 |
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邮箱 |
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电话号码 |
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科室/专业 |
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缴费方式 |
□转账 □支付宝 □刷卡(请选择在□打√) |
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银行信息 |
账户名称:南京思恒影科技有限公司 账号:10103301040012336 开户行:中国农业银行股份有限公司南京高楼门支行 |
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汇款备注 |
第一届微生物菌群分析班+姓名 |
注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给您发送确认函,谢谢支持!
11、在线支持服务
思影科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持与合作,确保学员能够熟练掌握数据处理方法。
12、人员简介:
王世明,南京理工大学副教授,硕士生导师。硕士毕业于南京农业大学,博士毕业于清华大学。曾主持过国家自然科学基金。
张嫡嫡,硕士,思影科技高级工程师,拥有多个数据处理项目经验。
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核磁:
第十届小动物脑影像班(上海,21.12.28-22.1.2)
北京:
第十一届任务态功能磁共振数据处理班(北京,12.15-20)
第五十三届磁共振脑影像基础班(南京,21.12.31-22.1.5)
脑电及红外、眼动:
北京:
第二届脑电机器学习数据处理班(B版本,北京,12.28-1.2)
重庆:
南京:
第四届脑电机器学习数据处理班(A版本,南京,12.6-11)
数据处理业务介绍:
第五十届脑影像基础班(重庆,11.19-24)
南京:
思影科技脑结构磁共振成像数据处理业务(T1)
思影科技啮齿类动物(大小鼠)神经影像数据处理业务
思影数据处理业务三:ASL数据处理
思影科技脑影像机器学习数据处理业务介绍
思影科技EEG/ERP数据处理业务
思影科技脑电机器学习数据处理业务
招聘及产品:
目镜式功能磁共振刺激系统介绍