1、培训简介
影像组学的概念自荷兰学者在2012年提出后,近年来得到了巨大的发展,其强调的深层次含义是指从影像(CT、MRI、PET等)中高通量地提取大量影像信息,从ROI(感兴趣区)勾画到特征提取与模型建立,凭借对影像数据信息进行更深层次的挖掘和分析达到对疾病进行鉴别诊断与疗效预测的目的,影像组学技术在临床科研中有着广阔的应用前景。
本次培训希望通过帮助临床医生理解影像组学的流程及具体分析方法,包括:病灶ROI勾画、特征提取和筛选、模型构建和临床数据解析。并以脑肿瘤磁共振影像数据为示例,进行指导和带教,确保参加的学员扎实掌握影像组学分析方法,从而提高专业人员开展神经影像相关研究工作的水平。
此次课程为影像组学课程,如对其他磁共振脑影像数据处理如脑功能,脑网络,机器学习或其他模态脑影像数据处理感兴趣,请浏览思影科技网站或微信公众号了解。
2、培训对象与内容
此次培训的对象是希望利用影像组学进行临床科研的医生、高校教师与在校学生等,思影科技一直坚持小班教学的方式,并配备教辅人员,后续提供在线支持,及时解决学员数据处理中存在的问题。参加本次课程的学员可免费重修一次。
内容主要包括:Python语言基础;ROI勾画软件的使用;影像组学原理及特征提取;特征筛选方法;常见模型:支持向量机与随机森林等;影像组学模型性能评估与可视化;回归及生存分析。 注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(10:00 - 20:00)熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜。
3、课程安排
时间 |
课程名 |
主要内容 |
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第一天 王典 9.15
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上午 |
Python语言入门1 |
· Python语言简介:特性与应用 · · Python编程环境介绍 · · Python数据类型:字符串、列表、字典等 · |
下午 |
Python语言入门2 |
· Python基本语法:运算、流程控制、函数与脚本的编写 · · Python常用包的介绍与安装 · |
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晚上 |
ROI勾画软件应用及图像预处理 |
· 3D Slicer勾画ROI · · 图像预处理:不同模态图像的配准、归一化等 · |
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第二天 王典 9.16
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上午 |
影像组学原理及特征提取 |
· 影像组学原理及其应用介绍 · · 影像组学经典论文解读 · |
下午 |
特征提取 |
· 特征提取:一阶统计特征、形状特征、纹理特征等(基于Pyradiomics、3D slicer等) · · 影像组学特征的解释及其临床意义 · · 数据集划分,table one快速制作; · |
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晚上 |
特征选择方法介绍 |
· 临床特征选择方法(单因素、多因素logistic回归) · · 组内和组间一致性分析(ICC); · · 影像组学特征选择方法 · |
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第三天 杨田雨 9.17
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上午 |
影像组学分析实操流程 |
· 预测模型的选取:分类与回归模型 · · 特征筛选:过滤法、最大相关最小冗余法、LASSO等 · · 预测效果的评估:精度指标、交叉验证等 · · 事后分析:重要特征、置换检验等 · |
下午 |
影像组学模型:支持向量机 |
· 支持向量机(SVM)的原理:支持向量分类(SVC)、支持向量回归(SVR) · · SVM实操:使用SVM进行肿瘤分类、使用SVR预测患者预后状况(基于Python) · |
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晚上 |
结果汇报&可视化 |
· 结果汇报注意事项 · · 结果可视化:ROC曲线、校正曲线、决策曲线分析(DCA)等 · |
第四天 杨田雨 9.18 |
上午 |
影像组学模型:随机森林 |
· 随机森林(RF)原理:集成学习、决策树 · |
下午 |
RF实操、结果汇报&可视化 |
· RF分类演示(基于Python) · · 结果汇报&可视化:精度指标、ROC曲线等 · |
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第五天 吴国伟 9.19 |
上午 |
R/RStudio 基础与入门(一) |
· R/RStudio界面简介 · · R的基本命令 · · R的数据结构(向量、矩阵、数据框、因子化等)及其创建、访问和修改 · · R的代码脚本、函数的编写和修改 · |
下午 |
R/RStudio 基础与入门(二) |
· 控制流(If/For等) · · 统计相关包、函数介绍 · · 管道函数的使用 · |
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第五天 王典 9.20
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上午 |
影像组学模型:LR(线性回归) |
· 线性回归及其变种:最小二乘回归、LASSO、岭回归、ElasticNet等 · · 回归分析实操(基于R语言) · |
下午 |
生存分析 |
· Logistic回归与Cox回归 · · 案例演示:生存率预测(基于R语言) · · 结果可视化:列线图(nomogram)等 · |
4、培训人数
此次课程限定人数,报名敬请从速。
5、培训地点
北京市石景山区城通街26号院(金融街长安中心)2号楼1501,具体见会议指南。
6、培训费用
所有参会人员3500/人(含资料费、培训费,交通及食宿费自理)。
7、报名方式
请将报名回执发送至:syfmri@vip.163.com
8、缴费方式
银行转账(转账信息见回执表)或者支付宝(bjsyfmri@163.com,户名:北京扬思影科技有限公司),也可现场刷公务卡,如需其他缴费方式,请与我们联系,联系方式见下文,谢绝录像,主办方提供发票。
9、联系方式
联系人:杨晓飞。
电话:010-68817143/18580429226
10、备注
请各位学员自带笔记本电脑Windows64位系统((推荐win10)、i5及以上、8G内存、50G剩余存储空间等基本配置;如无特殊情况请不要带苹果电脑,如确实只能用苹果电脑,苹果Mac电脑请提前使用Bootcamp加装Windows64位系统);学员自己有数据的可以带3-5例进行现场处理;请将回执表发送至syfmri@vip.163.com并及时缴费,便于安排。参加人员需提供北京健康宝,思影科技提供口罩。
报名回执表
单位名称、税号 (发票抬头) |
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姓名 |
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性别 |
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邮箱 |
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电话号码 |
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科室/专业 |
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缴费方式 |
□转账 □支付宝 □刷卡(请选择在□打√) |
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银行信息 |
户名:北京扬思影科技有限公司 账号:0200020009200097081 开户银行:中国工商银行股份有限公司北京白云路支行 |
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汇款备注 |
第六届影像组学班+姓名 |
注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给您发送确认函,谢谢支持!
11、在线支持服务
思影科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持与合作,确保学员熟练掌握数据处理方法。
12、培训人员简介:
杨田雨,硕士,拥有数学与计算机学科背景,擅长脑成像领域方法学,思影科技技术总监。
王典,数学硕士,具有多个科研项目数据处理经验,思影科技高级工程师。
吴国伟,博士,具有多个科研项目数据处理经验,思影科技高级工程师。
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