1、培训简介
影像组学的概念自荷兰学者在2012年提出后,近年来得到了巨大的发展,其强调的深层次含义是指从影像(CT、MRI、PET等)中高通量地提取大量影像信息,从ROI(感兴趣区)勾画到特征提取与模型建立,凭借对影像数据信息进行更深层次的挖掘和分析达到对疾病进行鉴别诊断与疗效预测的目的,影像组学技术在临床科研中有着广阔的应用前景。
本次培训希望通过帮助临床医生理解影像组学的流程及具体分析方法,包括:病灶ROI勾画、不同模态图像预处理以及配准、提取影像组学特征(包含MRI和CT图像)、特征筛选和降维、影像组学模型构建、组学分数构建和临床数据解析。主要以脑肿瘤磁共振影像数据为示例,进行指导和带教,确保参加的学员扎实掌握影像组学分析方法,夯实基础,从而提高专业人员开展神经影像相关研究工作的水平。建议学员可预习python基础知识。
此次课程为影像组学基础课程,如对其他磁共振脑影像数据处理如脑功能,脑网络,机器学习或其他模态脑影像数据处理感兴趣,请浏览思影以下链接(直接点击即可浏览),感谢转发支持。(可添加微信号19962074063或18983979082咨询):上海:
第四十四届扩散成像数据处理班(上海,8.7-12)
第一届Surface based fMRI分析专题班(上海,9.6-10)
重庆:
第三十八届磁共振脑影像结构班(重庆,8.15-20)
第二十六届脑网络数据处理提高班(重庆,9.16-21)
北京:
第二届Surface based fMRI分析专题班(北京,9.22-26)
广州:
第十七届磁共振ASL(动脉自旋标记)数据处理班(广州,9.2-5)
南京:
第一届静息态功能磁共振CONN专题班(南京,8.11-14)
第二十五届脑网络数据处理提高班(南京,8.23-28)
第一百二十二届磁共振脑影像基础班(南京,9.8-12)
数据处理业务介绍:
思影科技定量磁敏感(QSM)数据处理业务
思影科技影像组学(Radiomics)数据处理业务
思影科技深度学习(Deep Learning)影像组学数据处理
思影脑淋巴系统数据分析业务(WMH,FW-DTI,ALPS,PVS,gBOLD-CSF和脉络丛体积)
思影科技DTI-ALPS数据处理业务
思影数据ASL数据处理业务
思影科技灵长类动物fMRI分析业务
思影科技脑影像机器学习数据处理业务介绍
思影科技微生物菌群分析业务
思影科技EEG/ERP数据处理业务
思影科技近红外脑功能数据处理服务
思影科技脑电机器学习数据处理业务
思影数据处理服务六:脑磁图(MEG)数据处理
思影科技眼动数据处理服务
招聘及产品:
思影科技招聘数据处理工程师(广州,北京,上海,南京,重庆)
BIOSEMI脑电系统介绍
目镜式功能磁共振刺激系统介绍
2、培训对象与内容
此次培训的对象是希望利用影像组学进行临床科研的医生、高校教师与在校学生等,思影科技一直坚持小班教学的方式,并配备教辅人员,后续提供在线支持,及时解决学员数据处理中存在的问题。参加本次课程的学员本人可免费重修一次(不限时间和地点),如果您感兴趣请及早报名。
内容主要包括:Python语言基础;ROI勾画软件的使用;影像组学原理及特征提取;特征筛选方法;常见模型:支持向量机与随机森林等;影像组学模型性能评估与可视化;回归及生存分析。注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(10:00-20:00)熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜,也可以开班第一天上午8:30到。课程时间为上午9:00-12:00,下午14:00-17:00,晚上18:00-21:00。
3、课程安排
时间 |
课程名 |
主要内容 |
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第一天 安致远 10.11
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上午 |
Python语言入门1 |
· Python语言简介:特性与应用 · · Python编程环境介绍 · · Python数据类型:字符串、列表、字典等 · |
下午 |
Python语言入门2 |
· Python基本语法:运算、流程控制、函数与脚本的编写 · · Python常用包的介绍与安装 · |
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第二天安筱10.12 |
上午 |
ROI勾画软件应用及图像预处理 |
· 3D Slicer、ITK-SNAP勾画ROI · · 图像预处理:不同模态图像的配准、归一化等(包含MRI和CT图像) · |
下午 |
影像组学原理及特征提取 |
· 影像组学原理及其应用介绍 · · 影像组学经典论文解读 · · 特征提取:一阶统计特征、形状特征、纹理特征等(基于Pyradiomics、3D slicer等) · · 影像组学特征的解释及其临床意义 · · 组内和组间一致性分析(ICC) · |
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第三天 安筱 10.13
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上午 |
特征工程流程梳理 |
· 特征选择方法介绍 · · 特征归一化:最值归一化、z-score标准化 · |
下午 |
影像组学特征选择方法
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· 特征筛选:方差阈值法、统计检验法、过滤法、最大相关最小冗余法、LASSO、PCA等 · · 异常值筛选:IQR法、z-score法 · |
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第四天 安筱 10.14 |
上午 |
影像组学分析实操 |
· 数据集划分:交叉验证、留一法、简单划分 · · 预测模型的选取:分类与回归模型、超参数寻优 · · 预测效果的评估:精度指标、交叉验证等 · · 事后分析:重要特征、置换检验等 · |
下午 |
影像组学模型:支持向量机 |
· 支持向量机(SVM)的原理:支持向量分类(SVC) · · SVM实操:使用SVM进行肿瘤分类(基于Python) · |
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第五天 安致远 10.15 |
上午 |
影像组学模型:集成分类模型 |
· 集成学习、决策树、随机森林RF分类演示(基于Python)、随机森林RF分类演示(基于Python) · · 回归分析实操(基于python) · |
下午 |
影像组学模型:LR(线性回归及其变种)、SVR(支持向量回归) |
· 线性回归及其变种:最小二乘回归、LASSO、岭回归、ElasticNet等 · · 支持向量回归(SVR):使用SVR预测患者预后状况(基于Python) · |
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晚上 |
结果汇报&可视化 |
· 结果汇报注意事项 · · 结果可视化:ROC曲线、校正曲线、决策曲线分析(DCA)等 · · R语言入门 · |
第六天 安致远 10.16
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上午 |
影像组学模型:逐步逻辑回归 |
· Logistic回归原理及实操 · · 结果可视化:列线图(nomogram)、ROC曲线等 · |
下午 |
生存分析 |
· Cox回归原理及实操 · · 案例演示:生存率预测 · · 结果可视化:列线图(nomogram)、森林图、生存曲线等 · |
4、培训人数 此次课程限定人数,报名敬请从速。5、培训地点 上海市闵行区七莘路七莘红点城2号楼1103室,具体见会议指南。6、培训费用 所有参会人员3500/人(含资料费、培训费,交通及食宿费自理)。7、报名方式 请将报名回执发送至:syfmri@vip.163.com,可添加微信19962074063或18983979082获取报名表及盖章版本通知。
8、缴费方式
银行转账(转账信息见回执表)或者支付宝(shsyfmri@163.com,户名:上海集影科技有限公司),也可现场刷公务卡,如需其他缴费方式,请与我们联系,联系方式见下文,谢绝录像,主办方提供发票。
9、联系方式
联系人:杨晓飞。 电话:021-56635712/18580429226
报名回执表
单位名称、税号 (发票抬头) |
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姓名 |
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性别 |
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邮箱 |
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电话号码 |
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科室/专业 |
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缴费方式 |
□转账 □支付宝 □现场刷卡 □微信信用卡 (请选择在□打√) |
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银行信息 |
户名:上海集影科技有限公司 账号:1001203209300045983 开户银行:中国工商银行股份有限公司上海市大场支行 |
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汇款备注 |
第二十六届影像组学班+姓名 |
注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给你发送确认函,谢谢支持!
11、在线支持服务
思影科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持与合作,确保学员熟练掌握数据处理方法。
12、培训人员简介:
安筱,硕士,思影科技高级工程师,拥有多个影像组学数据处理项目经验。
安致远,硕士,思影科技高级工程师,拥有多个组学数据处理项目经验。
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核磁:
第一届Surface based fMRI分析专题班(上海,9.6-10)
北京:
重庆:
第三十八届磁共振脑影像结构班(重庆,8.15-20)
第二十六届脑网络数据处理提高班(重庆,9.16-21)
第四十五届扩散成像数据处理班(重庆,10.10-15)
广州:
第十七届磁共振ASL(动脉自旋标记)数据处理班(广州,9.2-5)
南京:
第一届静息态功能磁共振CONN专题班(南京,8.11-14)
第二十五届脑网络数据处理提高班(南京,8.23-28)
第一百二十二届磁共振脑影像基础班(南京,9.8-12)
脑电及红外、眼动:广州:
第十二届脑电机器学习班(Matlab版)(广州,8.13-17)
上海:
重庆:
第五十一届脑电数据处理入门班(重庆,8.28-9.1)
北京:
第十二届R语言统计班(北京,9.4-8)
南京:
数据处理业务介绍:
思影科技定量磁敏感(QSM)数据处理业务
思影科技影像组学(Radiomics)数据处理业务
思影科技深度学习(Deep Learning)影像组学数据处理
思影脑淋巴系统数据分析业务(WMH,FW-DTI,ALPS,PVS,gBOLD-CSF和脉络丛体积)
思影科技DTI-ALPS数据处理业务
思影数据ASL数据处理业务
思影科技灵长类动物fMRI分析业务
思影科技脑影像机器学习数据处理业务介绍
思影科技微生物菌群分析业务
思影科技EEG/ERP数据处理业务
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思影科技脑磁图(MEG)数据处理
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